GMKI Jakarta sebagai organisasi kemahasiswaan kristen yang memiliki basis kader disejumlah banyak kampus di Jakarta, pada 30 Maret 2012 malam sekitar pukul 9 WIB, mengalami tindakan pengejaran dan penyerbuan oleh puluhan polisi terkait dengan aksi demonstrasi GMKi Jakarta yang menolak rencana kenaikan harga BBM.
Puluhan polisi anti huru-hara dan sejumlah petugas polisi lainnya, mengejar aktivis GMKI Jakarta hingga ke dalam sekretariat GMKI Jakarta yang berada di Jalan Salemba Raya 10, bahkan termasuk juga mengejar hingga memeriksa ruangan kerja kantor Persekutuan Gereja-gereja di Indonesia (PGI). Akibat pengejaran tersebut, sekretariat GMKI Jakarta mengalami kerusakan yang cukup parah, dan sebanyak 19 orang aktivis GMKI Jakarta dan PP GMKI ditahan di Mapolres Jakarta Pusat.
Alasan kepolisian melakukan tindakan pengejaran tersebut, dikarenakan GMKI Jakarta telah melewati batas waktu unjuk rasa, dan melakukan aksi perlawanan dengan pelembaran batu yang melukai salah seorang polisi.
Aktivis GMKI Jakarta dan PP GMKI yang ditahan oleh pihak Polres Jakarta Pusat diantaranya adalah Ketua BPC GMKI Jakarta Januar Silalahi dan Ketua Umum PP GMKI Johnny Rahmat. (DPT)